Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp5lQ99LH9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms