Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarca5Q91ZW3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms