Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atl3Q91YH5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms