Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uhrf1Q8VDF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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