Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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