Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms