Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln1Q8R317 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms