Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vrk3Q8K3G5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vrk3Q8K3G5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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