Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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