Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms