Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot3Q8K0V4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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