Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms