Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx8Q8CFD4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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