Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx30Q8CE50 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx30Q8CE50 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx30Q8CE50 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx30Q8CE50 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms