Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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