Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms