Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms