Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms