Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc187Q8C5V8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc187Q8C5V8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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