Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubqln3Q8C5U9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms