Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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