Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms