Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTH8

Csnk1g1, Casein kinase I isoform gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g1Q8BTH8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g1Q8BTH8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnk1g1Q8BTH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1g1Q8BTH8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Csnk1g1Q8BTH8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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