Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms