Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms