Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc4Q8BKW4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms