Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim23Q8BGX0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms