Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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