Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubash3bQ8BGG7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubash3bQ8BGG7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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