Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc172Q810N9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms