Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Amigo1Q80ZD8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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