Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TnnQ80Z71 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms