Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms