Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms