Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn4bQ7M729 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn4bQ7M729 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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