Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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