Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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