Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc39a4Q78IQ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc39a4Q78IQ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc39a4Q78IQ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms