Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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