Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms