Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms