Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bnip1Q6QD59 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bnip1Q6QD59 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bnip1Q6QD59 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bnip1Q6QD59 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bnip1Q6QD59 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bnip1Q6QD59 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Bnip1Q6QD59 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Bnip1Q6QD59 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bnip1Q6QD59 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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