Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Tmeff1Q6PFE7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmeff1Q6PFE7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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