Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Herc4Q6PAV2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms