Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo3Q6P2B1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms