Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1qtnf6Q6IR41 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1qtnf6Q6IR41 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms