Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms