Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6DFW0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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