Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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