Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms